Dairy companies such as Meiji and Morinaga have increased milk and yogurt prices by one to eight percent.
「明治」や「森永」などの乳製品製造会社は、牛乳とヨーグルトの価格を１％から８％値上げしました。
increased ... prices「～の価格を上げる」で「値上げする」を表しています。increaseも、価格を上げるというときによく使われる単語です。
byには多くの意味がありますが、ここでは差分を表し、by Xのように数詞とともに使われます。
例えば、I missed the bus by three minutes.「３分のところでバスに乗り遅れた」や、My brother is older than me by three years.「私の兄は私より３歳年上です」のように言うことができます。